Según el ranking elaborado por el Monitor de Reputación Sanitaria en 2020 los hospitales de La Paz, Vall d´Hebron y Niño Jesús Madrid cuentan con los mejores servicios de pediatría y áreas específicas para niños. 

En el siguiente listado https://www.sanidad.gob.es/profesionales/CentrosDeReferencia/docs/ListaCSUR.pdf se puede encontrar los relación de centros, servicios y unidades de referencia (CSUR) del sistema nacional de salud designados para la atención o realización de las patologías o procedimientos que se indican. 

La Unidad de Gestión Clínica de Pediatría del HURS es centro de referencia para Cardiopatías Congénitas, Oxigenación de Membrana Extracorpórea (ECMO) y soporte mecánico con dispositivos de asistencia ventricular. Es también, el único Centro de Referencia de nuestra Comunidad Autónoma para trasplantes pediátricos: cardiaco, hepático y pulmonar.  

Los centros de referencia para el diagnóstico y tratamiento de todas las neoplasias infantiles: Hospital Universitario La Paz (Madrid), Sant Joan de Deus (Barcelona), Vall d’Hebron 

Hospital Universitario Virgen del Rocío es centro de referencia para trasplante renal pediátrico, quemados, trasplante de progenitores hematopoyéticos alogénico infantil, enfermedades metabólicas congénitas.